Aktivitet og innsats er organisert via 4 vekstspesifike arbeidsgrupper med deltakende eksperter fra de Nordiske landene. Arbeidsgruppene er faglige nettverk som driver prosjekter og kommer med faglige innspill til NordGens ansvarlige for de ulike vekstgrupper.
Arbeidsgruppene treffes 1-2 ganger om året. Medlemmer oppnevnes av de ulike landenes myndigheter.