NordGen samarbetar med genbanker, forsknings- och förädlingscentra på såväl nordisk som global nivå. Utanför Norden deltar vi i ett omfattande internationellt samarbete inom ramarna för FAO som är FN:s livsmedels- och jordbruksorganisation och Bioversity International. Vi har också det operativa ansvaret för det globala frövalvet: Svalbard Global Seed Vault.
NordGen har flera projekt som syftar till att utveckla och stötta andra länders genbanksarbete. Dessa är till största delen finansierade av SIDA.
Baltikum
NordGen stöttar det baltiska genbanksarbetet genom att sköta dokumentation, stå för servrar, m.m.
Södra Afrika
Inom ramen för SADC (Southern African Development Community) och dess program för bevarande av växtgenetiska resurser i södra Afrika utbildar NordGen i genbanksarbete: fröbehandling, uppförökning dokumentation, IT och management.
Centralasien
I Centralasien hjälper NordGen till att starta och bygga upp genbanker i bland annat Kirgisistan.
Svalbard Global Seed Vault
Det var organisationerna Bioversity International och FAO (Food and Agriculture Organization) som inspirerades av NordGens säkerhetslager i en nedlagt gruva på Svalbard och kontaktade norska myndigheter. Detta ledde så småningom till öppnandet av the Svalbard Global Seed Vault (SGSV) år 2008 som ska fungera som ett extra säkerhetslager för all världens fröer.
Det är Norge via Landbruk- og matdepartementet (LMD) som äger SGSV men driften regleras i ett trepartsavtal mellan LMD, Global Diversity Trust som finansierar försändelser av fröer från biståndsland samt NordGen. NordGen har det dagliga driftsansvaret för lagring, mottagande och kontraktskrivning med donatorer.